DiFerrer faça o seguinte, o seu trafo tem 2 saídas, sendo que uma delas é para a alimentação do motor do spindle 48V e a outra controla a lógica e a etapa de potência dos motores de passo juntos (não é o correto).
O ideal seria vc deixar os 48V desta fonte somente para o motor do spindle e comprar 2 outros trafos , 1 trafo de 9V por 2A para a lógica pois a sua controladora tem um regulador 7805 para o trabalho correto dos 5V, (a lógica é 5V e não 9V) e outro trafo de 24V por 2A para os motores de passo (lembrando que esses 2Ampers serão de acordo com os seus motores de passo, se seus motores forem diferentes destes do link você terá que recalcular os valores).
Separe as ligações da lógica e dos motores de passo.
O máximo permitido para a controladora dos motores de passo é de 36V, então se você comprar um trafo de 24V depois de retificado ele terá 32V o que estará dentro de um parâmetro de conforto.
Agora se você não tiver conhecimento de eletrônica ou mesmo elétrica sugiro que não faça por conta própria ou poderá sair mais caro o molho que o peixe.

Traduza a página (se não entende o Inglês) e olhe os detalhes do fim desta página que vc entende-rá.

http://lab.whitequark.org/notes/2014-02-11/cnc3020t-fixing-power-supply/

Este é o esquemático da controladora do Spindle. 

Obrigado Viumau.
Vou providenciar os trafos, já combinei com um amigo que entende bem de eletrônica, ele fará a ligação pra mim.
Assim que estiver funcionando te aviso.
Desde já te agradeço pela ajuda e pela força que tem dado.
Obrigadão.

Sem problemas, precisando é só falar, DiFerrer não deixe de postar as modificações e os concertos, assim poderá ajudar a outros que tenham o mesmo problema aqui no fórum. 

Olá DiFerrer, acredito que, ou você não leu toda a matéria dos links, ou não entendeu os valores do esquemático, ou não entendeu nada do que te falei, então vamos lá, você não irá usar os 48V do tafo para os motores de passo, os 48V serão somente para o Spindle (isole as outras saídas, não as use para outro fim).
Para os motores de passo vc terá que usar um trafo de no máximo 36V (como mostra no esquemático e como está descrito no fórum CncZone se o você leu).
Se a sua controladora não têm o 7805 para os 5V da lógica (providencie), já lembrando que estes 5V terão que vir de uma trafo separado (dedicado para ele), ou seja, ou vc manda enrolar um trafo com 3 saídas independentes com 9V, 18V e 36V (valores já retificados) ou compra 3 trafos,  (1º trafo de 9v para para se usar com o regulador 7805 e fornecer os 5V da lógica), (2º trafo com 18V para o regulador 7812) e por fim o (3º trafo com 36v para alimentação dos motores de passo).
Então por favor, informe ao técnico que está te auxiliando que não se pode alimentar o motor do spindle e os motores de passo com o mesmo trafo ou com a mesma saída, por diversas razões, ruídos, interferências magnéticas, retorno de corrente, sobre tensão entre outros...
Existe um erro que eu ainda não corrigi neste esquema, as tensões de entrada são DC (corrente contínua) e não AC (corrente alternada).
Ok, espero ter ajudado...

Oi Viumau. Tudo bem?

A minha controladora ainda está na oficina, vai dar cria, por isso ainda não postei nada.
Forte abraço.

Olá DiFerrer, desculpe a demora para responder mais estou em viagem (fora de Sampa), deixe ver se entendi a suas dúvidas, se movimentar os motores manualmente com a alimentação ligada os motores pesam, (sim, o correto é pesarem mesmo).
Se os motores estiverem totalmente desligados (desligados e separados) da controladora e da alimentação logicamente que será fácil vira-los na mão, se você somente juntar todas as pontas dos fios do motor e tentar virar o eixo, verá que ficará mais difícil de virar, então imagina os motores ligados (mais difícil ainda), então está correto!
O barulho possivelmente é a ressonância do motor pelo controle "chopper" da controladora, (é como um barulho de pernelongo, bem alto e chato), se nos testes não estava ocorrendo o barulho e o endurecimento do acionamento dos motores é sinal que tinha algum problema e que agora está correto.
Não acredito que o problema seja configuração do Mach3.

Aqui está a foto da placa com a peça que aquece mais.

Obs. Esqueci de agradecer. Muito obrigado pela ajuda, se não fosse você estaria no maior desespero.

Bom pessoal Boa noite.

Agora que a chinezinha está funcionando mais ou menos gostaria de trocar informações e experiências com as pessoas que tenham a mesma CNC para nos ajudarmos com dicas e avanços conseguidos pois a coisa não é tão fácil não mas estou avançando aos poucos.
Estou à disposição de quem precisar.
Abraço à todos.

Diferrer

Oi Rymaeda.

Obrigado por perguntar mas o barulho que escuto é diferente, o que ouvi no vídeo é como se ela perdesse a engrenagem, no meu caso, quando movimento o eixo "y" por uns 200 mm ela faz um barulho como se estivesse deslizando num eixo sem lubrificação ( um pouco forçado), devo ter mexido em alguma coisa que não devia. Não tenho certeza mas acredito que seja micro passos sim pois também é a TB6560. 

Vou até pedir para o VIUMAU se ele pode me mandar uma configuração do MACH 3 (ele conhece bem essa controladora). Eu comprei a minha cnc usada, então não tenho nenhuma documentação dela, como a controladora deu defeito e agora está arrumada não tenho nenhum parâmetro se a configuração está correta ou não.

Pedro Ferreira