Meu MEGA2560 tem uma falha na impressão ... ele tem 14 saídas PWM e não apenas 11 como descrito na placa!!
Desenhando um circuito com base neste Arduino, precebi que no microcontrolador tem mais 3 saídas que estão ligados aos pinos, 44, 45 e 46 (marcados como digitais na placa).
Liguei eles no scope e fiz um teste ... ele varia o duty certinho ...
Fica então a dica de uso de mais 3 PWM (saídas 44, 45 e 46) do Arduino MEGA2560 totalizando 14 saídas!


Abraço!