Voltando ao escopo do assunto...
ACHO que o problema desse aumento na corrente se deve à forma como o L297 controla a corrente,
que é formada de um oscilador de onda QUADRADA(pelo menos na 3AX) que aciona o flip-flop.
Quando em SET(metade do ciclo) o flip-flop liga o enrolamento em questão e ignora qualquer sinal de RESET por parte do VSense,
Com uma fonte que tenha uma baixa resistencia interna, nesse periodo a corrente pode superar em muito a regulada em VRef, ultrapassando o limite do L298/FET.
Não creio que na prática a curva de corrente sob esse regime seja aquele lindo dente de serra esboçado nos graficos do L297, tanto no data sheet quanto em um AN que o Sir Jorge postou a alguns dias(em outro post), o clock não é simétrico.
Por esse motivo TALVEZ a cnc3ax com clock em 50% pule ciclos em função da alta corrente aplicada e a demora em "dissipá-la" pelo diodo.
Se eu me equivoquei em algo, pro favor me corrijam
Abraços