Segue ilustração de ligação, é só repetir a sequência nos demais eixos. Lembrando que o XE,YE,ZE (habilita sinal) não será utilizado pois é habilitado automaticamente. Espero ter ajudado!
Controladora--------------------------------Drive
XN------------------------------------------Dir- e Pul-
XD------------------------------------------Dir+
XS------------------------------------------Pul+
XE,YE,ZE---------------------------------- (não utiliza)