Paulo,
A coisa deve ser por outro caminho...
Lí um pouco o manual do EMC, e ví umas coisas interessantes - por exemplo a possibilidade de se usar o sinal de "enable", e me ocorreu que isso pode estar acontecendo - o enable não está ativo na sua configuração...
De qualquer forma, eu penso que deveremos então fazer a coisa com calma.
Uma das sugestões deles é que criemos uma cópia dos arquivos de configuração para não corrermos riscos desnecessários...
Para criar e editar configurações para a sua eletrônica sem alterar os arquivos originais do EMC2:
O EMC2 usa arquivos de exemplo para demonstração de funcionamento, e portanto seria interessante copiar estes arquivos usados para configuração em uma pasta sua.
Supondo estar usando o Ubuntu, a partir do Menu "Locais", selecione o comando "Computador"...
Dois cliques em "Sistema de Arquivo" - "etc" - "emc2" - "sample-configs".
Você verá uma série de nomes como "sim", "stepper", "motenc", etc...
Escolha "stepper" (se não me engano tem "stepper_mm") - clique com o botão direito do mouse e escolha "copiar";
Na mesma janela do "Navegador de Arquivos" escolha a pasta "home" (pasta pessoal);
No menu Arquivo, escolha "Criar Pasta" = escreva "emc2";
Dois cliques na pasta "emc2" e criar outra pasta chamada "configs";
Clique com o botão direito do mouse sobre ela e comande "colar..."
Para editar um dos arquivos (por exemplo "stepper_mm.ini"), clique com o botão da direita e escolha "Abrir com Editor de Texto";
Depois de editado e salvo, poderá abrir o programa pelo ícone apropriado (de inicialização normal do EMC).
Lá verá uma pasta chamada:
/home/<seu nome>/emc2/configs