Olá Gustavo, acredito que o metalon não seja o mais indicado pois é muito fino para fixar as guias lineares, se bem que já me passou isso pela cabeça também, algo assim, fazer uma régua de ferro chato de 4mm com rosca para todos os furos da guia depois no metalon fazer furos passantes com 1mm de folga para ajustagem e por fim colocar esta régua com rosca dentro do metalon, mas como disse não recomendo, apenas passou pela cabeça, o alinhamento e nivelamento não é difícil, se tiver uma estrutura rígida as próprias guias se nivela e se alinha, e o metalon não dá a rigidez necessitaria para isso. 

Não sou Expert em cnc mas trabalhei um bom tempo com metalurgia de exatidão, a ideia e ter uma estrutura rígida, estou construindo minha primeira maquina e até o momento não estou encontrando dificuldades na construção, eu indicaria tubos de 80mm de 3 a 4 mm de espessura no frame principal e perfis de 2.5mm para reforço de estrutura.
 O perfil estrutural de alumínio seria uma boa opção para quem tem acesso a este tipo e produto, é muito rígido leve e pratico, o valor é um pouco mais salgado se comparado ao ferro , mas elimina muita mão de obra.