Gisele,
Dificil falar alguma coisa assim sem ver, mas à princípio parece que voce fez a lição de casa...
Apenas para sua informação e quem sabe isso ajuda a experimentar um pouco mais:
Por padrão, o eixo "X" será acionado pelos pinos 2, 3, 4 e 5 da LPT
o eixo "Y" pelos pinos 6, 7, 8 e 9
o eixo "Z" pelos pinos 1, 14, 16 e 17
Estes são os pinos de "saída" de uma LPT
Há outros pinos restantes - 10, 11, 12, 13 e 15 - são os pinos de "entrada" e por enquanto nem mexa com eles.
A maioria dos drivers precisa que os pulsos tenham um tempo de duração em nivel alto e em nivel baixo (um ciclo completo), e se aumentar demasiado a frequencia, acontece o que voce percebeu...
Já que deu este passo, o próximo agora é procurar um programa de controle, e nesse caso eu conheço dois que podem te ajudar: turbocnc para DOS e EMC² para linux.
Atenção para alguns detalhes:
o Tcnc só roda em DOS - pode ser prompt de DOS do Windows 98, mas não janela de dos - nem dele nem do XP (que não tem DOS)
O EMC é linux - pode tentar baixar uma imagem ISO, queimar um CD e instalar em um computador - depois fazer algumas configurações para fazer sua plaquinha funcionar...
Espero que isso ajude