Lucas estes parâmetros vc deve informar na hora de gerar o percurso no Mach3.
Quando você abre o percurso, aparece a opção "Z seguro da máquina" que é quando ela sobe o "Z" entre uma um recorte e outro por exemplo, dentro de um mesmo percurso.
E você também pode definir a posição inicial, que é quando inicia e termina a usinagem.
Espero que tenha tirado sua dúvida.

Lucas,

Uma das maneiras de se fazer isso seria usando um sensor de origem para o eixo Z.

Quando o cnc é inicializado, o operador faz com que a máquina procure os sensores de origem e então os digitais de posição são zerados nestes pontos.
Uma vez que o cnc reconheça onde estão as origens, sabe-se onde a máquina está no espaço e consequentemente onde o trabalho está.

Estas medidas ou dimensões podem ser armazenadas em um arquivo de coordenadas não volátil, e que podem ser resgatadas à qualquer momento através do operador ou de arquivo.

Creio que o que voce quer está relacionado à limites lógicos (soft limits), mas para ser efetivo é necessário que a máquina possua os sensores de origem.

Uma vez que o cnc tenha reconhecido as origens, automáticamente pode-se limitar o volume útil e assim a máquina pode trabalhar dentro desta área pré definida e não vai colidir com os extremos.