Sandro,
BELEZA!!
vou tentar explicar ,do meu jeito ,
tem uma maneira muito simples e eficiente ,pois o mach calcula o passo por unidade automaticamente .
vai la em (Set Step per Unit) ai você digita uma distancia qualquer para o para o eixo que você quer calibrar ,exemplo: dite 100 ,confirma e aguarda a maquina se movimentar ,mesa a distancia que a maquina se movimentou ,exemplo :97mm e então coloque o valor que você mediu na janela que abriu ,confirma ,pronto o mach vai calcular a relação automaticamente .
faça isso nos três eixos .
dica ,tente usar a maior distancia possível de cada eixo ,desta forma você diminui a marge de erro ,use velocidade baixa para não correr o risco de perder passos.
abraço .