Olá. Eu tive o mesmo problema com um cnc que opero na empresa de um amigo. Entrei em contato com o fabricante (Delta CNC) e disseram que não havia solução. Mas tem solução sim... Abra o Mach3 e clique na aba "Settings (Alt-6). Logo acima do botão RESET tem um botão "Set steps per unit". Você clica nele e vai abrir uma janela... Escolha o eixo que vai calibrar e dê ok. Vai perguntar quanto vc quer que o eixo se mova. insira um valor (é importante que os valores G20 ou G21 estejam configurados pq determinam a unidade de medida polegada ou mm). A mesa se move conforme o valor e em seguida irá abrir outra janela perguntando quanto se moveu realmente. Você deve inserir o valor, e Mach3 calcula sozinho.