Luis,

Eu já fiz algumas conversões para cnc usando esta mini fresadora...

Estas fotos são a última criação!




Diga lá, quais suas dúvidas com o Mach3 - quem sabe consigo lhe ajudar.

... é possível através de software colocar no programa a área de trabalho da maquina?sem colocar sensores de inicio e final de curso?

Sim, como voce mesmo respondeu, através das configurações de cursos na janela "Origem/Limites Lógicos".
Entenda que estes limites são melhor usados quando a máquina é dotada de sensores de origem fixos na máquina, mas nada impede que se use a função sem os sensores...
 

...seria e possível posicionar um motor em determinado ponto na área de trabalho através do Mach 3?

Acredito que esteja falando das teclas de movimentação manual...

São as setas do teclado - direita e esqueda para o eixo "X", p/ cima e p/ baixo para o eixo "Y" e as teclas "Page Up" e "Page Down" para fazer subir e descer o eixo "Z"

Hoje foi a primeira vez que configurei a placa no computador e deu-me o seguinte erro External Estop requested após uma pesquisa na net vi que era preciso habilitar o lowid correspondente e essa a medida mais acertada para esse caso?

O botão de emergencia pode ter uma função emulada ou pode ser atuante, dependendo do tipo de máquina, aplicação ou necessidade.

Para uma máquina pequena como esta pode ser dispensado, mas entenda que é uma necessidade do programa ter um comando que sinalize o estado de emergencia (e que neste caso usa o botão RESET da tela).
Voce pode ajustar o estado do sinal de entrada (campo Active Low) para que ele funcione adequadamente, ou pode ignorar o comando fisicamente, como na imagem abaixo:

Olá Meste gilii,
Parabens, a sua machina é muito bonita. O acabamento como tambem os detalhes de cada item, merecem elogios. Eu sempre dico que o olho quer a parte dele.
Abraço
Alberto