Eu pensaria em um maquinário mais simples e manual, como uma fresadora tradicional e um torno tradicional.

Penso que este tipo de máquinas sejam mais adequadas ao tipo de trabalho que não é repetitivo.

Uma das virtudes de um equipamento cnc é justamente a repetição ou produção de lotes de peças...

Bem, não pense que usar um maquinário cnc é mais fácil que o tradicional

Num maquinário cnc, além dos conhecimentos de usinagem tradicionais há a necessidade de conhecer um pouco de CAD e de programação de máquinas, produção, etc...

À princípio o caminho é mais longo que envolve conhecimentos de diversas áreas, mas em compensação por ser mais completo e atual pode ser visto com bons olhos já que é uma tecnologia cada vez mais difundida na indústria...

Esta pergunta é difícil de ser respondida, pois penso que já que são peças para protótipos, muitas vezes há necessidade de medidas apertadas o que pede por máquinas de certa acuidade ou mesmo flexibilidade do equipamento no que tange resolver certos problemas de geometrias...

Como fresadora, penso sempre numa fresadora ferramenteira (ou semelhante) e claro, acompanhada de certos dispositivos que, dependendo do departamento ou do interesse, podem ser desenvolvidos por voces mesmos (ou podem ser adquiridos no mercado já prontos).

Como torno penso numa máquina robusta e justa, e com um tamanho médio - talvez algo com 750mm entre pontas, mas barramento largo para ter estabilidade.
Placa de 3 castanhas entre 6" e 8", passagem de árvore acima de 28mm e se possível, barramento com cava postiça.