Esta pergunta é difícil de ser respondida, pois penso que já que são peças para protótipos, muitas vezes há necessidade de medidas apertadas o que pede por máquinas de certa acuidade ou mesmo flexibilidade do equipamento no que tange resolver certos problemas de geometrias...
Como fresadora, penso sempre numa fresadora ferramenteira (ou semelhante) e claro, acompanhada de certos dispositivos que, dependendo do departamento ou do interesse, podem ser desenvolvidos por voces mesmos (ou podem ser adquiridos no mercado já prontos).
Como torno penso numa máquina robusta e justa, e com um tamanho médio - talvez algo com 750mm entre pontas, mas barramento largo para ter estabilidade.
Placa de 3 castanhas entre 6" e 8", passagem de árvore acima de 28mm e se possível, barramento com cava postiça.