Bom dia Lezigo, vamos ver se consigo te ajudar:
1º - Seria possivel você tirar algumas fotos de sua máq., principamente nas extremidade dos eixos, onde o motor é fixado no eixo, pra ver se o acoplamento é por mangueira ou acoplador de aluminio, pois ja tive o mesmo problema que você, e o problemas esta no acoplamento do eixo com motor, eu estava usando pedaços de mangueira e braçadeira para apertalas. Com o uso houve o desgaste da mesma e ai fica perdendo o passo;
2º - Tambem pode ser a configurção do Mac3. Faça um quadrado de 500 X 500 mm e um circulo da mesma medida no artcam, crie um percuro e mande executar. Preste atenção se o ponto final esta se encontrando com o ponto inicial. Se não, pode ser a falta de um pequeno ajuste no mac, nada sério. No proximo post, te mando fotos de como ajustar, pois agora estou no trampo.
Fico aguardando as fotos, se seu acoplamento do motor for com mangueira e braçadeira, de uma apertada nas mesma e faça o procedimento 2
Grande abraço

 tive um problema semelhante e cabei de arrumar no meu casso que estava acontesendo , amesma coisa , oprblema era folga no eixo tirei a folga pronto ficou zerada , de uma olhada nas extremidades dos eixos e verifique , não pode ter folga . abraço

Cara o motor de 10kgf nunca me descepcionou, pois como trabalho com avanços relativamente baixos (na faixa de 1000mm/min) não chega a forçar, e mesmo indo mais além também nunca me descepcionou. E como eu disse a maquina peguei num acerto, pq a empresa estava sem $$ pra pagar o que me devia, logo não conheço muitos detalhes da mesma, e também estava nova, nunca tinha sido usada.
Sobre o driver, não sei qual o modelo, também não sei se está em micropasso (já não intendo muito dessa área), isso influencia nos defeitos apresentados??

Enfim um problema a menos! Estava lendo outros tópicos, dei mais uma olhada na maquina e vi que estava com uma pequena folga entre os rolamentos que travam o fuso do eixo na posição, aproveitando o embalo, troquei a mangueira de acoplamento e as abraçadeiras. Montei tudo e estava tudo perfeito! Fiz o teste do quadrado e do circulo e ambos coincidiram com extrema perfeição o início e o fim. Estou upando uns videos para mostrar os detalhes da maquina, filmei enquanto estava realizando este teste. Segue umas fotos do antes e depois do concerto. Notem na primeira foto os "degraus" causados pelo desalinhamento. Na segunda foto nota se que as passadas coincidiram perfeitamente, apenas ficou com um pequeno serrilhado que acredito que é causado pelo problema numero 2 citado no início do tópico, que está tirando minhas noites de sono. Agora com a parte mecanica resolvida estou pensando nas partes que não tenho muito conhecimento que é a eletronica e o software. Nos videos que seguem abaixo dá pra ter uma noção desse problema, que parece que a maquina trabalha dando trancos ao invés de ter um avanço linear. Tentei fazer um teste aumentando ainda mais o avanço para ver se não era o fato de estar trabalhando em baixa velocidade (aprox. 800mm/min), mais quanto mais aumentava a velocidade os trancos só ficavam mais fortes que chegava a chacoalhar a mesa onde está a maquina.

O amigo Denilson questionou sobre os passos, e a unica coisa que sei responder a princípio é que na configuração do mach 3, está setado como 133,33 passos por mm, aceleração de 500 e velocidade de 2000, e os dois quadrinhos que ficam mais a direita está em 5 e 0 (não me recordo a informação solicitada nesses quadrinhos). Esses dados são para os eixos x e y, para o z já é diferente pois o passo do fuso é diferente. Sobre os fusos, acabei esquecendo de medir o passo dos mesmos, a unica informação que sei é que são trapezoidais com aprox. 15mm de diametro, para Z é um pouco mais fino, aprx. 10mm.

Acredito que seja algo relacionado a configuração, pois em G0 movimentando pelo JOG, todos os motores funcionam perfeitamente, atravesso a mesa de cabo a rabo, paro, volto, com avanço de 2000mm e vai normalmente. Agora quando está executando alguma rotina começa o pesadelo com os "trancos", isso trabalhando a velocidades bem menores, não consigo chegar a 1500 de avanço que parece que vai desmontar a maquina de tanto solavanco.

Router cnc quadrado

(teste do quadrado, o som está estrondozo, coloque seu volume no mínimo antes de assistir!!!)

Routwr cnc círculo

(teste do circulo, aqui aparece bem o problema citado acima dos trancos, note pelo proprio barulho, ou pelo movimento principalmente da esteira porta cabos que é onde fica mais visível pelo vídeo os solavancos)

Se alguem puder me ajudar, alguma dica, alguma coisa, pois sou leigo no assunto e sinceramente não sei pra onde correr pra resolver isso.

Pra mim esse problema é driver ou controladora. Como q a máquina tá cortando um círculo e o eixo Y tá girando como se tivesse dando passos??? A minha tem um movimento sempre contínuo nos eixos. Quando ela não está cortando nada (movimento no ar), os eixos giram normalmente ou ficam dando esses "passos" ??
Outra coisa: Pare de sofrer com esses pedaços de mangueira, acoplamento é mt melhor. Abraço.