Usar reconhecimento de imagem e alinhamento por software, não me parece a melhor opção em termos de precisão, tendo em vista que no projeto de uma placa, os furos, trilhas e demais elementos estão normalmente alinhados em coordenadas retangulares ortogonais. Ao girar uma placa poucos graus, o alinhamento ortogonal na placa ainda existe, mas demandará movimentação mais complexa e sincronizada nos eixos (x,y), com alguma perda de precisão, a depender da resolução do CNC. Na produção de um lote de placas, poderá haver problemas de repetibilidade. Além disso, há a resolução e a estabilidade mecânica da câmera. Tudo isto poderá comprometer o alinhamento entre as faces.