cara o problema pode ser altura de corte e velocidade e ainda o kerf que é a espeçura de corte cada chapa tem uma diferente vide tabela da fonte, cabo terra bem fixo na mesa verifique estas opções que é pra resolver

então, são vários fatores, normalmente as maquinas hypertherm trabalham com o bico da tocha colado a peça, como é uma cnc provavelmente a sua altura esta regulada pouca coisa acima da chapa, um dos sintomas de o problema ser a altura seria a grande facilidade em se perder o arco,  se isso estiver acontecendo pode ser um indicio no entanto acho que não seja isso, pode ser realmente a linha de ar, você tem um filtro secador coalescente instalado? esse filtro é recomendado para essa aplicação? outra coisa pode ser a velocidade de corte, imagino que você deve ter recebido as instruções de regulagem do equipamento de plasma e esta configurando tudo certinho?! sinceramente os plasmas da hypertherm são muito fáceis de operar, no entanto pra quem nunca teve instruções ai fica um pouco mais difícil; ajudaremos no que possível com a sua ajuda nas informações sobre o corte, configuração da máquina, etc etc