Olá home built cnc?
Esse controle é no Mach3, lá você edita conforme sua necessidade mas a chamada do comando já é feito pelo pós processador na geração do gcode, tipo no Sheetcam uso o pós " Mach3 com plasma no Z". No Artcam não usei mas procure um que possua essa chamada de M code.
Gere o gcode e abra ele com o notepad, perceba se quando é terminado o corte da peça ele gera um M5, que irá desligar a tocha e subir o Z, e quando começar o corte da próxima peça se começa com M3, isso também será percebido no início do primeiro corte. No M3 está a rotina que falei anteriormente.
ABraço!