Se depois de descer para a altura de furação, o eixo ainda desce para a altura de corte (suponho que depois de uma pequena pausa para executar a furação) o eixo Z demora a se recuperar, pode ser necessário ajuste da velocidade de reação do eixo em função da ordem de descer (ou subir) enviada pelo THC.
No Mach3 (pela de plasma) há uma janela que se chama "THC Speed", e o valor padrão deve estar em torno de 20 (20% da máxima velocidade do eixo Z) - este valor varia conforme o THC e a capacidade de deslocamento do eixo Z (baseado em velocidade e aceleração do sistema), e deve ser ajustado para controle correto da velocidade de reação do THC...
É normal em furos, inicio de corte e final de corte o THC ordenar que a tocha desca, pois a tensão sobe quando não há material sendo cortado na frente da tocha, então uma das alternativas é criar algumas regras (no Sheetcam) para desligar o controle de altura do THC nestes casos.
A dica é resolver uma coisa de cada vez - primeiro eu tentaria ver de acertar estas velocidades de reação - depois resolveria as regras de corte...