O que está me matando de curiosidade, é saber como que é feito o controle de quando o bico desce encosta na chapa e zera automaticamente, sobe os 5mm e começa o corte, não tem nenhum sensor de altura pelo seu código aqui no arduino. o THCperm no seu código:
while(PlasmaOn > 80 && THC_perm > 900)
tem alguma coisa a ver com o vídeo do cara mexendo no sheetcam?