Encontrei também algumas diferenças na montagem física das placas cnc3ax e cnc3ax modular:

Cnc3ax
DB25 = Pino 1: ENB A,  Pino 14: ENB B,  Pino 16: ENB C
Cnc-3am (modular)
DB25 = Pino 1: ENB X, ENB Y, ENB Z e ENB A
 
Cnc3ax
DB25 = Pinos 8 e 9 = Sem ligação
Cnc-3am (modular)
DB25 = Pino 8: Step A, Pino 9 : Dir A
 
Cnc3ax
DB25 = Pino 10 jump com Pino 17 sem ligação
Cnc-3am (modular)
DB25 = Pino 10 = STOP, Pino 11 = END X, Pino 12 = END Y e Pino 13 = END Z
 
Cnc3ax
DB25 = Pino 14: ENB B
Cnc-3am (modular)
DB25 = Pino 14: Controle de alimentação 12Vcc e 5Vcc

Cnc3ax
DB25 = Pino 16: ENB C
Cnc-3am (modular)
DB25 = Pino 16: Sem ligação
 
Cnc3ax
DB25 = Pino 17: JUMP pino 10
Cnc-3am (modular)
DB25 = Pino 17: Sem ligação
 
Cnc3ax e Cnc-3am (modular)
Pinos 18 a 25: GND----ok

Então pergunto, devo seguir a mesma configuração da cnc3ax ou devo configurar a portas paralelas de uma outra forma?
Outra questão e quando alimento a placa com os 12v o relé mantem sem acionar mas quando adiciono o cabo do Pc ele aciona, é normal?
Em anexo um diagrama que fiz das ligações da placa modular.

Boa noite Gil,

  Mais uma vez agradeço sua dedicação por ajudar a quem tem duvidas. Já entrei em contato com o vendedor que por sinal foi muito atencioso tentando me auxiliar. Ele até pediu que enviasse a placa para tentar solucionar o problema, mas vai acabar ficando inviável pois terei despesas com envio mais conserto e acredito que essa placa não vale a pena.
  Acabei passando esse domingo e segunda tentando entender mais um pouco dessa placa e consegui fazer um paralelo entre a cnc3ax e a modular, realmente o funcionamento delas e quase idênticas, temos algumas diferenças citadas acima.
  Os primeiros testes feitos foram os de sempre: 5v entre os pinos 2 (GND) e 12 (tensão enviada do L7805cv), medir 100 Ohms entre pino3 eixo X, pino 5 eixo Y e pino 7 eixo Z e pino 17 do L297, continuidade entre os pino 1 (SYC) dos L297, pinos 2 e 11 do l297 ligados no GND, todos os fet’s IRF640N isolados e com dissipadores, continuidade (Souce) IRF 640N entre testes de continuidade nas trilhas...

  Leituras nos pinos do L297:
P1=3,48v(SYC), P2=0v(GND), P3=0,26v(led acesso)3,47v(led apagado), P4 -P6-P7-P9=0,03V ou 4,49V, P5-P8 =4,49V, P10=5,0v, P11=0v (GND), P12=5,03v, P13-P14=0v, P15=0,2v(corrente motor), P16=2,6v, P17 e P18=0,14 ou 3,3v,P 19=0v (JUMP HALF) e P20=5,0v.

  No 74LS09N as portas logicas estão funcionando corretamente: P1=0v,P2=4,47v, P3=0,18v,P4=4,48v,P5=4,48v, P6=11,87v, P7=0, P8=0,18v, P9=0v, P10=4,48v, P11=11,87v, P12=4,47, P13=4,47v e P14=5,0v.

  Montei também os diodos para simular o funcionamento do motor de passo, mas não cheguei a alimentar.
  Algumas duvidas que talvez possa me ajudar:
- Tenho que ligar a alimentação dos motores para realizar a verificação dos níveis de tensão nos CI’S?
- Com a placa energizada (12Vcc) ao tocar com o multímetro para medir tensão no pino 6 do DB 25 o led indicativo de movimento do eixo Z acende e apaga, isso é comum?
- Utilizando o multímetro com a uma ponta de prova (preta) no GND e a outra nos pinos 17 (DIR) e 18 (STEP) do L297 não consegui mudança no nível de tensão, manteve constante em 3,3v com o cabo ligado ao PC , mach3 ligado e configurado e acionando o Page Down e Page Up.
- O relé SRD12vdc continua ativando mesmo desabilitando o pino14 do DB25 onde se encontra ligado.
Após esses testes abri o programa Parmon e consegui a mudança de estado manualmente, acredito que o problema não seja a porta do PC.

  Segue imagens da placa e da configuração do eixo Z:

Senhores;

 Neste fim de semana acabei de testar os outros eixos da placa cnc3ax-M. Por enquanto só realizei testes alimentando a parte logica da placa com 12Vcc.
 Utilizando o multímetro fiz as medições de tensão nos pinos dos CI’s e dos Fet’s e todas as medições seguiram o mesmo padrão.
 O interessante e que o led, correspondente ao movimento do eixo localizado no pino 3 do L297, encontravam-se desligado e quando realizava a medição no pino 18 do L297 o led acendia e modificava o nível de tensão de 4,4v para 0,02v ou de 0,02v para 4,4v nos pinos 4,6,7 e 9 do L297 e nos terminais dos  FET’s também modificou os níveis de tensão de 0,18v para 11,8v. Tocando novamente no pino 18 o led desligava e o nível de tensão retornava ao valor inicial.
Realizando esse procedimento seria como se o programa (PC) manda-se pulsos no pino 18 (ClocK) do L297?