Louro, acredito fortemente que o problema não é de configuração do Mach3, pois como disse antes, consigo monitorar o sinal, com um led em qualquer pino de saída que eu configure. Isto significa que o micro esta mandando o sinal corretamente e este chega até a controladora.
Minha controladora é de 3 eixos e tenho o arquivo de configuração que é diferente da de 5 eixos.
Também ja inverti o sinal para "active low"
Ainda não tive tempo para retirar o rele, como disse antes, mas assim que o fizer, informo.
Abs.