Guilherme,
Boa tarde. Eu faria uma estrutura mais robusta (pesada), já que a sua mesa (x,y) me parece de ferro fundido ou aço com guias em rabo de andorinha, eu faria algo mais compatível, o que possibilitaria usinar metais. Ou seja, o eixo z seria feito a partir de uma estrutura em chapas de aço soldadas ou um perfil (U ou I) de aço, essa estrutura seria fixada à sua base (por exemplo, através de uma placa base em aço ou ferro fundido espessa, > 25 mm), com isso a sua estrutura em metalon não teria finalidade estrutural, apenas, talvez para formar uma caixa de proteção contra ruídos.
Além disso, sendo um material de espessura fina, rígido e oco, uma estrutura em metalon poderia atuar como uma grande caixa de ressonância, caso fosse utilizada como parte da estutura da máquina. Nesse caso, as peças em metalon receberiam esforços que gerariam vibrações em diversos modos.
Caso opte por uma estrutura mais pessada, seria interessante chumbá-la à uma base em concreto ou uma mesa de madeira pesada, a caixa em metalon anti-ruídos ficaria por fora, sem contato com a base da máquina, para minimizar a transmissão de vibrações à caixa.