Villas,
O vácuo vai ter que ser mantido por longos períodos?
Talvez envernizar a caixa ajudaria a vedar melhor...
Para a tampa, teria de haver uma guarnição de borracha em toda a borda, e de preferência sem emendas...
Existe um material (mas confesso que não lembro o nome) que é vendido em metro, tem seção redonda e pode ser emendado através de calor.
Este material é usado para fazer correias de transmissão, e existe em vários diametros e durezas...
Já usei dele para fazer guarnições desse jeito.
Na borda da caixa basta fazer um rebaixo simples de forma que a guarnição se encaixe nele, e que sobre um pouco dela para fora, para que fique em contato com a tampa.
Usei exatamente estes grampos (só que o modelo com regulagem de pressão)...