Posso estar errado, mas normalmente deve-se levar em conta algumas dimensões para se fazer o corte como se deseja.

Em alguns programa o operador informa a distancia entre as torres, o tamanho do bloco a ser cortado e a posição desse bloco em relação às torres, e claro as dimensões (e posição) dos perfis a cortar (e em que lugar do bloco estão posicionadas).

Ele leva em consideração isso tudo para que no final o corte saia do tamanho que deseja.

Se o programa de controle da máquina não tiver estas opções, o operador deverá prover meios de compensar todas estas diferenças.

Eu por exemplo usaria um programa CAD comum para simular todas estas variáveis e assim determinar a escala correta dos perfis que quero usar para gerar a peça que desejo, e assim geraria os percursos de cada torre...